Fédération Lyonnaise de Modélisation et Sciences Numériques

Nom du projet / Région

  • Fédération Lyonnaise de Modélisation et Sciences Numériques, comprenant :
    • le PSMN (Pôle Scientifique de Modélisation Numérique ENS de Lyon).
    • le CBP (Centre Blaise Pascal ENS de Lyon).
    • le P2CHPD (Pôle de Compétence en Calcul Haute Performance Dédié Université Lyon I).
    • le PMCS2I (Pôle de Calcul et Modélisation en Sciences de l’ingénieur et de l’information ECL).

- Rhône-Alpes


Site web

http://www.flmsn.univ-lyon1.fr/

Formations


Année de création
- 2009 pour la FLMSN.
- 2009 pour le CBP.
- 2000 pour le P2CHPD.
- 1999 pour le PMCS2I
- 1993 pour le PSMN.


Responsables scientifiques et techniques

  • Responsables :
    • Pr. Marc Buffat (FLMSN Université Lyon I).
    • Pr. Ralf.Everaers (CBP ENS de Lyon).
    • Marc. Buffat (P2CHPD Université Lyon I).
    • Hervé. Gilquin (PSMN ENS de Lyon)
    • Fabien. Godeferd (PMCS2I ECL).
  • Responsables techniques :
    • Dan-Gabriel. Calugaru (PMCS2I ECL).
    • Hervé. Gilquin (PSMN ENS de Lyon).
    • Christophe. Pera (P2CHPD Université Lyon I).
    • Emmanuel. Quemener (CBP ENS de Lyon).

Localisation

- Lyon


Participants (laboratoires, universités, entités, industries)

Environ 30 laboratoires de recherche rattachés à l’Université de Lyon, au CNRS, à l’INRIA, à l’INSERM, soit plusieurs centaines de chercheurs de l’UCB Lyon 1, INSA, ENS de Lyon, ECL.
Domaines : sciences physique, astrophysique, chimie, SPI, mathématique, sciences de la terre, biologie, mécanique des fluides, mécanique, énergétique, transport, génie civil, informatique et sciences humaines.


Moyens humains (équivalent temps plein)

- PSMN : 1 IR à 100%, 1 IR à 50% , 1 ATI Réseau à 100% ; soit 2.5 ETP.
- CBP : 1 IR à 100%, 1 IR à 50% ; soit 1,5 ETP.
- P2CHPD : 1 IR à 100%, 1 IE à 100% ; soit 2 ETP.
- PMCS2I : 1 IR à 50% ; 1 IE à 50%, soit 1 ETP.

Total : 7 ETP


Moyens informatiques et puissance crête théorique actualisée (processeurs, réseau d’interconnexion, stockage)

- Nombre total de coeurs :

  • Environ 15 000 coeurs

- PSMN :

Statistiques d’utilisation des cluster du PSMN
http://www.ens-lyon.fr/PSMN/doku.ph...

  • Acquis en 2010-2011-2012 :
    • Un cluster d’environ 250 serveurs, /sratch commun Glusterfs de 48TO, Infiniband QDR demie-bande passante comprenant :
    • 13 serveurs bi-socket hexa-coeur Intel X5650, 2,66 Ghz, 4Go/coeur.
    • 12 serveurs bi-socket hexa-coeur AMD Istambul 2,66 Ghz, 2,5Go/coeur, (Infiniband QDR).
    • 15 serveurs quadri-socket octo-coeur AMD Magny-cours 2,3 Ghz, 4Go/coeur, (Infiniband DDR).
    • 120 serveurs bi-socket quadri-coeur Intel x5570 2,93 Ghz, 3Go/coeur,
    • 72 serveurs bi-socket hexa-coeur Intel X5650, 2,66 Ghz, 2Go/coeur,
    • 24 serveurs bi-socket quadri-coeur Intel X5672, 3,2 Ghz, 6Go/coeur.
  • Acquis en 2013-2014-2015-2016 :
  • Un cluster d’environ 280 serveurs, /sratch commun Glusterfs de 92TO, Infiniband FDR demie-bande passante comprenant :
    • Acquis en 2013-2014-2015 :
      • 172 serveurs bi-socket, octo-coeur Intel E5-2670, 2,6 Ghz,8G0/coeur.
      • 24 serveurs bi-socket, octo-coeur Intel E5-2670, 2,6 Ghz,16G0/coeur avec /scratch SSD 1TO.
      • 42 serveurs bi-socket, octo-coeur Intel E5-2667v2, 3,3 Ghz, 8G0/coeur.
      • 8 serveurs bi-socket, octo-coeur Intel E5-2670, 2,6 Ghz, 8G0/coeur et 2 GPGPU par serveur.
      • 2 serveurs bi-socket, quadri-coeur Intel E5-2637v2, 3,5 Ghz, 16G0/coeur 2 GPGPU par serveur.
      • 8 serveurs bi-socket, quadri-coeur Intel E5-2637v3, 3,5 Ghz, 16G0/coeur 2 GPGPU par serveur.
      • 1 serveur quadri-socket octo-coeur Intel E5-4640,, 2,4 Ghz, 24Go/coeur (mémoire totale 768GO).
    • Acquis en 2016 :
      • 24 serveurs bi-socket, octo-coeur Intel E5-2667v4, 3,2 Ghz, 8G0/coeur.
      • 12 serveurs bi-socket, octo-coeur Intel E5-2667v4, 3,2 Ghz, 16G0/coeur.
      • 8 serveurs bi-socket, 16 coeurs Intel E5-2697Av4, 2,6 Ghz, 16G0/coeur.

Total : environ 7500 coeurs :

144 coeurs (AMD Istambul 2,3 Ghz), 480 coeurs (AMD Magny-cours 2,3 Ghz), 592 coeurs (Intel X5570), 1020 coeurs (Intel X5650), 192 coeurs (Intel X5672), 3264 coeurs (Intel E5-2670), 672 coeurs (Intel E5-2667v2), 32 coeurs (Intel E5-2637v2), 72 coeurs (Intel E5-2637v3), 32 coeurs (Intel E5-4640), 576 coeurs (Intel E5-2667v4) et 256 coeurs (Intel E5-2697Av4).

- CBP :

  • Acquis avant 2010 (PSMN) :
    • 80 serveurs bi-socket quadri-coeur Intel Nehalem 2,66 Ghz, 3Go/coeur, (Infiniband QDR).
    • 24 serveurs bi-socket quadri-coeur Intel Hapertown 2,83 Ghz, 2Go/coeur, (Infiniband DDR).
    • 18 serveurs bi-socket quadri-coeur Intel Hapertown 2,83 Ghz, 4Go/coeur, Infiniband DDR).
  • Acquis en 2010-2015 :
    • 4 serveurs bi-socket hexa-coeur Intel X5650, 2,66 Ghz, 2Go/coeur, (Infiniband QDR) avec GPGPUs.
    • 12 stations de travail quadri-coeurs avec GPGPUs.

Total : environ 1200 coeurs :

640 coeurs Nehalem 2,66 Ghz, 528 coeurs (Intel Hapertown 2,66 Ghz) et 48 coeurs (Intel X5650) .

- P2CHPD :

  • Acquis en 2010-2011-2012 :
    • Un cluster de 18 serveurs bi-socket quadricoeur intel X5365, 2Go/coeur, (Infiniband DDR).
    • 2 serveurs bi-socket quadricoeur intel X5550 + 1 baie GPGPU (4x Tesla 1040).
    • 3 serveurs bi-socket quadricoeur intel X5580, 7Go/coeur, (Infiniband QDR).
    • 4 serveurs bi-socket quadricoeur intel X5550, 7Go/coeur, (Infiniband QDR).
    • 2 serveurs quadri-socket hexacoeur AMD 8435, 10Go/coeur.
    • Un cluster de 36 serveurs bi-socket quadri-coeur Intel Nehalem, 2,66 Ghz, 3Go/coeur (Infiniband QDR).
    • Un cluster de 36 serveurs bi-socket quadri-coeur Intel Nehalem, 2,66 Ghz, 3Go/coeur (Infiniband QDR).
    • 3 serveurs bi-socket quadri-coeur Intel Nehalem, 2,66 Ghz, 3Go/coeur.
    • 6 serveurs bi-socket quadri-coeur, Intel E5620, 2,4 Ghz, 3Go/coeur.
  • Acquis en 2013-2014-2015-2016 :
    • 6 serveurs quadri-socket octo-coeur Intel E5-4640, 2,4 Ghz, 16Go/coeur (mémoire totale 256GO).
    • Un cluster de 223 serveurs bi-socket, octo-coeur Intel E5-2670, 2,6 Ghz, /sratch commun Lustre de 70 TO, (Infiniband FDR demie-bande passante). comprenant :
    • Acquis en 2013-2014-2015 :
      • 168 serveurs bi-socket octo-coeur Intel E5-2670, 2,6 Ghz 4G0/coeur.
      • 6 serveurs bi-socket octo-coeur Intel E5-2670, 2,6 Ghz 16 G0/coeur.
      • 30 serveurs bi-socket octo-coeur Intel E5-2670v2, 2,5 Ghz 2 G0/coeur.
      • 10 serveurs bi-socket octo-coeur Intel E5-2670v2, 2,5 Ghz 8 G0/coeur.
      • 10 serveurs bi-socket octo-coeur Intel E5-2670v2, 2,5 Ghz 16 G0/coeur 2 GPGPU par serveur.
    • Acquis en 2016 :
      • 9 serveurs bi-socket octo-coeur Intel E5-2640v3, 2,6 Ghz 8 G0/coeur.
      • Total : environ 4800 coeurs :

144 coeurs (Intel x5365), 48 coeurs (Intel X5550), 12 coeurs (Intel X5580 coeurs, 48 coeurs (AMD Istambul), 600 coeurs (Intel Nehalem 2,66Ghz), 48 coeurs (Intel E5620), 2784 coeurs (Intel E5-2670), 800 coeurs (Intel E5-2670v2) et 144 coeurs (Intel E5-2640v3).

- PMCS2I :

  • Acquis en 2010-2011-2012 :
    • 1 serveur SGI UV 1000 avec 192 coeurs (Intel x5650) et 1 TO de mémoire, /scratch de 10 TO.
    • 1 serveur ICE 8200/8400 avec 384 coeurs (Intel Xeon) et 1,2 TO de mémoire.
    • 32 serveurs bi-socket quadri-coeur Intel E5540/E5550/X5675, 2,53/2,66/3,06 GHz, 3 à 9GO/coeur, (Infiniband DDR).
  • Acquis en 2013-2014-2015-2016 :
    • 7 serveurs bi-socket hexa-coeur Intel X5675, 3,06 GHz 6GO/coeur, (Infiniband DDR).
    • Acquis en 2013-2014-2015 :
    • Un cluster de 48 serveurs bi-socket, octo-coeur Intel E5-2640v3, 2,6 Ghz, (Infiniband QDR demie-bande passante) comprenant :
      • 40 serveurs bi-socket octo-coeur Intel E5-2640v3, 2,6 Ghz 4 Go/coeur.
      • 6 serveurs bi-socket octo-coeur Intel E5-2640v3, 2,6 Ghz 16 Go/coeur.
      • 2 serveurs bi-socket octo-coeur Intel E5-2640v3, 2,6 Ghz 32 Go/coeur.
    • Acquis en 2016 :
      • 4 serveurs bi-socket octo-coeur Intel E5-2640v3, 2,6 Ghz 4 Go/coeur.
      • 2 serveurs bi-socket octo-coeur Intel E5-2640v3, 2,6 Ghz 32 Go/coeur.

Total : environ 1800 coeurs.

- Stockage Total : 3000 TO

  • PSMN : 10 serveurs de /home et bases de données pour 2000 TO .
  • P2CHPD : 4 serveurs de /home pour 440 TO .
  • PMCS2I : /home de 300 TO et robot de 4 lecteurs LTO-4, 96 slots (90 TO).

- Puissance crête théorique totale : 296 Teraflop/s

  • PSMN : Environ 140 TFlops crête.
  • CBP : Environ 13 TFlops crête.
  • P2CHPD : Environ 93 TFlops crête.
  • PMCS2I : Environ 50 TFlops crête.

- Puissance crête théorique totale des accélérateurs de calcul : 65 Teraflop/s

  • PSMN : Environ 18 TFlops crête.
  • CBP : Environ 22 TFlops crête.
  • P2CHPD : Environ 23 TFlops crête.
  • PMCS2I : Environ 2 TFlops crête.

- Puissance crête théorique totale aggrégée : 360 Teraflop/s


Types de codes (expertise), domaines d’application

- PSMN

  • ADF, CPMD, CP2K, Gaussian, Namd, Lammps, Molcas, Q-chem, Siesta, Turbomole, Vasp, ... pour la Chimie.
  • Castep, Gaussian, ... pour la RMN.
  • MRBayes, PhyML, SNPScanner, Spinevolution, Velvet, ... pour la biologie.
  • PWSCF, Siesta ... pour la physique.
  • Abinit pour l’astrophysique et les sciences de la terre.
  • Programmes développés en interne ou en collaboration pour tous les laboratoires.
  • Maple, Matlab et Scilab.

- CBP

  • CPMD, CP2K, Gaussian, Namd, Lammps, Molcas, Q-chem, Siesta, Turbomole, Vasp, ... pour la Chimie.
  • Abinit pour l’astrophysique et les sciences de la terre.
  • Programmes développés en interne ou en collaboration pour tous les laboratoires.
  • Scilab.

- P2CHPD

  • Codes industriels avec licence : fluent, comsol, mapple, matlab.
  • Codes industriels sans licence : Gaussian, siesta, lammps.
  • Codes développés en interne par les utilisateurs/laboratoires.

- PMCS2I

  • Codes industriels commerciaux pour la CFD : elsA (ONERA), Cradle.
  • Codes industriels commerciaux pour la mécanique : Abaqus, Nastran.
  • Codes industriels "libres" pour la CFD : Saturne, OpenFoam, Arps.
  • ANSYS Fluent, FreeFEM++, TurbFlow.
  • Programmes développés en interne ou en collaboration pour tous les laboratoires.
  • Matlab, librairies Nag.

Nombre moyen d’utilisateurs

- PSMN : 400 enregistrés, 80 utilisateurs en moyenne mensuelle.
- CBP : 100 enregistrés, 10 utilisateurs en moyenne mensuelle.
- P2CHPD : 150 enregistrés, 40 utilisateurs en moyenne mensuelle.
- PMCS2I : 120 enregistrés, 50 utilisateurs en moyenne mensuelle.


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