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Offres de stages

Offre de stage à l’ONERA, publié le 3/02/2012

Offre de stage (6 mois) concernant le logiciel CEDRE. Il s’agit d’optimisation du code (plutôt orienté MPI, voir OpenMP, voir évaluation d’outil à la HMPP, P4all)

Détails sur le site de l’ONERA, référence DSNA-2012-09 : http://sites.onera.fr/stages/stages-dsna

Offre de stage au BRGM, publié le 9/01/2012

Paralléliser un code d’écoulement à surface libre 2D.

Tous les détails de l’offre sont publiés sur le site du BRGM

Offre de Stage de Master, publié le 17/11/2011

Offre de stage de Master (débouchant sur une thèse) sur la simulation numérique de la dynamique des globules rouges à l’I3M à Montpellier.

Intégration d’un moteur de maillages 3D dans un logiciel multi-plates-formes, publié le 03/01/2011

Descriptif de l’offre

Proposition de stage pour un étudiant en informatique, publié le 22/04/09

Public concerné : étudiants en informatique

Nature du stage : stage de 2 ou 3 mois à partir de juin 2009.

Commentaire : L’étudiant(e) participera au développement du code Eco3M (Ecological Mechanistic and Modular Modelling) conçu au LOPB (UMR6535) et destiné à la modélisation biogéochimique des écosystèmes aquatiques. Ce code a été développé en fortran 90.

En fonction de ses compétences et de ses goûts, l’étudiant pourra opter pour :

un travail visant à améliorer les performances de calcul du code en :
- améliorant l’optimisation lors de la compilation (choix d’options judicieuses,...)
- parallélisant quelques instructions du code à l’aide de l’outil openMP
- mettant en place des sorties du modèle au format netCDF ou

un travail visant à améliorer la convivialité (interface graphique) et la visibilité (site internet) du code

Compétences souhaitées obligatoires : linux

Compétences liées au choix 1 : Fortran 90, openMP, Makefiles Compétences liées au choix 2 : outil de réalisation d’interfaces graphiques sous linux (par exemple avec java ou autre bibliotheque graphique (tcl/tk)), développement de sites internet (notamment avec spip)

Durée du stage : 2 mois à partir de juin 2009 + possibilité de prolongation d’un mois avec un statut de vacataire

Lieu du stage : Laboratoire d’Océanographie Physique et Biogéochimique, bat. TPR2 ; 6ème étage ; campus de Luminy, Marseille

Rémunération : stage de 2 mois rémunéré sous forme de gratifications (379 euros nets par mois quelque soit le niveau d’étude) + possibilité de vacations pour prolonger le stage (800 à 1000 euros nets pour 120 h en fonction du niveau d’études)

Contacts : Melika BAKLOUTI (m.baklouti - @ - univmed.fr, 04 91 82 93 74 / 06 89 73 94 69)

développement d’outils logiciels pour l’étude de phylogénie moléculaire, 18/03/08, Jean-Bernard Emond

Dans le cadre de travaux de recherche sur l’étude de phylogénie moléculaire nous recherchons un stagiaire ingénieur.

Objectif : Porter, développer ou optimiser sur une des deux grappes de calcul du laboratoire des outils de reconstruction d’arbres phylogénétiques inclus ou non dans la suite logicielle bio-informatique Bioteam Inquiry. Certains outils logiciels permettant l’alignement de séquences ou l’analyse de données de génétique des populations pourront aussi être pris en compte. Une interface facilitant le choix raisonné des outils et leur utilisation pourra être proposée. Les outils à utiliser seront ceux de la suite de développements Gnu ou Xcode d’Apple, ainsi que les librairies MPI, SGE ou Xgrid. L’ensemble des nouveaux codes développés sera sous la licence libre "CeCIL".

Les programmes ou suites logicielles concernés seront les suivants : PAUP, POY, PAML, PHYLIP, MrBayes, PHYML, HYPHY, EMBOSS, ClustalW-MPI, Mesquite, R.

Vous trouverez ci joint un descriptif du stage de 3 mois que nous proposons.

L’élève ingénieur aura une rémunération de 560 euros net chaque mois.