L’objectif de votre travail sera de développer des méthodes d’analyse multi-traits pour appréhender et comprendre les liens entre réponses physiologiques et comportementales afin d’identifier les phénotypes qui permettraient de sélectionner les individus les plus résilients face à des challenges nutritionnels. Nous disposons d’une base de données (acquise dans le cadre du projet européen GENTORE https://www.gentore.eu/) météorologiques, physiologiques (production laitière, indicateurs de mobilisation corporelle) et comportementales (activité enregistrée par capteurs) relevées sur 62 vaches de race laitière et allaitante (races se caractérisant par des potentiels laitiers contrastés et donc associés très certainement à des profils adaptatifs différents). Vous utiliserez ces données pour analyser les réponses comportementales des vaches face à des challenges nutritionnels et comprendre les liens entre réponses productives, physiologiques et comportementales afin de caractériser la résilience des animaux. Des techniques de modélisation de séries temporelles (par exemple : recalage, transformé en ondelettes, chaînes de Markov) seront utilisées pour analyser la cinétique des différentes réponses de l’animal afin d’en capturer leur complexité. Puis ces cinétiques (acquises à différentes échelles temporelles) seront combinées afin d’identifier différents profils adaptatifs de vaches avec des potentiels laitiers contrastés (Holstein, Montbéliarde et Charolaise).
Vous serez plus particulièrement en charge de :
- Analyser les cinétiques des variations comportementales, productives et physiologiques lors de challenges nutritionnels
- Déduire les profils adaptatifs comportementaux, productifs et physiologiques et comprendre le lien entre eux
- Caractériser la résilience multi-trait d’un animal face à des challenges nutritionnels
