MISSIONS :
Il ou elle travaillera en collaboration avec les équipes scientifiques du LGPM (en particulier, l’axe Bio ingénierie de la Chaire), participera au développement d'outils numériques (développement de codes ou utilisation de logiciels open sources) pour modéliser les systèmes bioprocédés. Cela concerne les bioréacteurs, par exemple en bio-production de médicaments, pour lesquels une approche 0D est suffisante (réacteur parfaitement mélangé) et des systèmes spatio-temporels (fermentation en milieu solide, colonisation de scaffold) pour lesquels la formulation est un système d'équations aux dérivées partielles. Selon les compétences de la personne recrutée, le système spatio-temporel sera résolu par des méthodes continues (volumes finis) ou discrètes (automates cellulaires). Notre expertise se situe dans l'aptitude à formuler le comportement biologique, à coupler ce comportement avec des interactions physiques (transferts de nutriments, gaz, métaboliques…) puis à calibrer le modèle avec des données expérimentales. La personne recrutée travaillera dans le cadre d'un projet ANR récemment accepté en interaction avec d'autres chercheurs du laboratoire (imagerie 2D et 3D, bioréacteurs, cultures immobilisées, cultures en microfluidique, spectrométrie Raman, chimie analytique…) et avec le consortium de ce projet.MISSIONS:
He or she will work in collaboration with the LGPM scientific teams (in particular, the Bioengineering axis of the Chair), participate in the development of digital tools (code development or use of open source software) to model bioprocess systems. This concerns bioreactors, for example in drug bioproduction, for which a 0D approach is sufficient (perfectly mixed reactor) and spatio-temporal systems (fermentation in a solid medium, scaffold colonisation) for which the formulation is a system of partial differential equations. Depending on the skills of the person recruited, the spatio-temporal system will be solved using continuous methods (finite volumes) or discrete methods (cellular automata). Our expertise lies in the ability to formulate biological behaviour, to couple this behaviour with physical interactions (transfers of nutrients, gases, metabolism, etc.) and then to calibrate the model with experimental data. The person recruited will work on a recently accepted ANR project, interacting with other researchers in the laboratory (2D and 3D imaging, bioreactors, immobilised cultures, microfluidic cultures, Raman spectrometry, analytical chemistry, etc.) and with the project consortium.
